環保署於今年夏季，針對澄清湖等9處自來水淨水場水源及淨化處理後清水水質，進行產毒藻種及藻類毒素調查。檢測結果顯示：各淨水場水源中可測到低濃度之微囊藻毒素，其範圍為28-235奈克/公升。至於經自來水淨化處理程序後，清水中之濃度則進一步降低至2.4-65奈克/公升，以上含量均遠低於世界衛生組織飲用水標準建議值（1000奈克/公升）。
環保署表示：自今年3月起委託國立成功大學環工系林財富教授進行飲用水水源及水質中藻類毒素調查。水源採樣調查地點包括本島澄清湖、仁義潭、牡丹水庫、曾文水庫、翡翠水庫、新山水庫以及離島金門太湖、榮湖、蓮潭共9處。自來水淨水廠清水採樣調查地點包括本島澄清湖、公園、石門、曾文、直潭、新山及離島金門太湖、榮湖、紅山水廠等9處。本次調查亦評估淨水場處理程序對藻類毒素去除處理之效能，除澄清湖高級淨水程序去除效率可高達95﹪外，其餘8處淨水場以傳統程序去除微囊藻毒之效率亦可達40﹪。
環保署強調，將持續監測國內飲用水重要水源及水廠出水之水質中藻類毒素含量，相關調查成果將可作為飲用水藻毒問題管理重要參考依據，以確保民眾飲用水水質安全。