環保署針對9月4日環評初審會審查六輕健康風險評估報告當天，有關台灣水資源保育聯盟之訴求，說明環保署之立場如下：
一、劉建國立法委員建議將「六輕相關計畫之特定有害空氣污染物所致健康風險評估報告」與雲林縣政府委託台大詹長權教授的報告一起審查討論，環保署將發文請雲林縣政府提供歷年委託調查報告，並一起參與環保署環評專案小組審查。
二、環保署9月4日召開該案專案小組審查會議當天所發之資料，並不是新聞稿，而是承辦同仁為方便開會時對台灣水資源保育聯盟當天上午在環保署門口召開記者會之訴求有所說明，所提供之發言資料。
三、至於台塑公司六輕健康風險評估報告中有關六輕廢氣燃燒塔揮發性有機溶劑（VOC）及致癌風險如何計算，評估項目是否應增加及其他涉及事實認定等事項，因事涉實體審查，環保署表示，應由專案小組委員進行專業審查以釐清事實。