生化戰劑具有毀滅性，殺傷範圍廣，全民受威脅，防護不易，因此，全民防護系統非常重要。為加強政府及全民的防護力量，因應911美國恐怖攻擊事件的發生，行政院環保署將聯合中央各部會及台北市政府各單位，於十月二十七日上午十時在捷運小南門站進行恐怖份子毒氣攻擊事件緊急應變演練。希望藉由此次的演習，提升各相關機關及民眾對於毒氣攻擊事件發生時的處理能力，並熟練救災資源的整合運用，防止災害擴大，將災害損失減至最低，減少生命、身體及財物的損失，行政院張院長對本次演習甚表重視，並至演習現場關切。
為防範交通樞紐及人口密集的公共場所遭有心人士施放毒氣後，群眾因不知如何因應，心生恐慌，造成不必要的傷亡，此次演習特別規劃以人口密集的台北都會區大眾交通樞紐捷運站，假想恐佈份子毒氣攻擊事件的應變救護為主要演練項目，表現政府相關單位的緊急動員及應變能力。
環保署表示；本次演習過程係由恐怖份子在捷運電聯車車廂施放化學毒氣，車廂內頓時煙霧四起，乘客掩鼻跑出車廂，多名旅客因吸入過量毒氣倒臥月台，另有多人痙攣、呼吸困難、抽搐、嘔吐、頭痛、暈眩及昏迷等情形，捷運公司管理單位在察覺異狀並接到旅客通報後，立即淨空車廂、疏散乘客，在判定可能遭受毒氣攻擊，立即通知消防、憲警及環保單位到場處理，同時隨即成立災害應變中心，協調各單位展開救災工作。
緊接著消防人員在接獲捷運公司報案後，立即指派八位穿著A級防護衣進入捷運站內搜救，並將受傷民眾立即救出送醫治療，環保局人員隨後亦穿著A級防護衣進入，進行毒氣偵測作業，經檢測發現不是屬於環保署列管的毒性化學物質後，立即通知現場指揮官，通知國軍快偵小組進行偵測，並通知工研院毒災諮詢中心協助研判，經相關諮詢單位研判後，可能為沙林毒氣，由於災情持續擴大，此時台北市政府及中央均成立災害應變中心。
國軍快研小組在接獲通知後，立即以M90毒氣偵撿器實施偵測，偵檢器在接觸化學戰劑後即發出警報，並辨別毒劑種類及濃度，隨即偵檢士以閃光標示器標示污染源，在判定化學戰劑種類與研擬應採取的防護措施後，小組長向現場指揮官提出專業建議，並下達解毒命令，以液體消毒氣及氣體消毒氣對捷運列車及污染地區進行除毒作業，最後快研小組對消除後的污染區實施複偵，以確定除毒成效。
在捷運站內演習的同時，捷運站外也有接獲救災指揮中心的台大醫院及和平醫院派遣八輛救護車、十位醫師及十位護士抵達現場開設現場急救站；同時由台北市衛生局指派毒化災害急救責任醫院〈台大醫院〉立即出動醫療除污設備抵達現場，並由醫護人員穿著C級防護衣於急救站展開醫療除污及檢傷分類。因災情持續擴大，消防局在指派一輛化學災害處理車、四輛水箱車、兩輛救護車到達現場並再派十二位穿著A級防護衣人員進入現場，擴大搜尋受傷民眾。
最後在快速研判小組確定除污成效後由中央指揮官宣布災情控制，災害狀況解除，進行復原工作，統計災害損失及補償事宜，並召集專家及憲警單位依法調查、蒐證及偵辦，捷運公司也在確認完成現場毒氣清除後，檢查修復相關設備，於八小時後恢復全線通車。
環保署說；本次演習動員陸軍化學兵、警察、消防、衛生、環保等單位，與會貴賓包括行政院長、各部會首長及縣市長參與。環保署強調；台灣地區過去雖尚無人口密集地區內恐怖份子毒氣攻擊事件，但也須預防其發生的可能性，本次演習後也將提出災害檢討及改善因應措施，同時該署也將製作毒災防護手冊提供民眾及地方政府處理類似事件參考。