環保署郝署長於今年四月十五日中宣示南崁溪流域污染整治決心，流域內事業每週不定期稽查，環保署即擬定「南崁溪流域事業廢水加強稽查管制作業計畫」，兩個多月來，環保署與桃園縣環保局稽查管制已初具成效，總計稽查205廠次，其中夜間稽查21廠次、假日稽查74廠次、一般日110廠次，夜間及假日稽查佔46%。採取一百二十八廠次放流水水樣，已知38廠次違反環保法規，其中違反水污染防治法32廠次、違反廢棄物清理法10廠次(4廠次同時違反水污法)。屬假日或夜間稽查查獲違反者為十九廠次，佔違反廠次50%。已處罰8廠次，處罰金額達新台幣一百六十七萬四千元。
環保署指出，南崁溪全長30.7公里，流域內列管事業將近一千家，平均三十公尺就有一家事業，其行業別以印染整理、洗染業、金屬表面處理及電鍍業居多，事業分布之密集可謂全台之冠，導致南崁溪水體水質受事業污染的比例，高達六成左右，另外，流域內新社區林立，人口達四、五十萬人，產生的生活污水污染量佔污染比例約四成，根據本署統計資料顯示，南崁溪嚴重污染河段則高達89%，高居全台第二位，污染情形嚴重，因此，管制工業廢水排放及污水下水道系統建設為整治南崁溪首要工作。
環保署結合桃園縣政府共同推動整治，期望以全方位整治南崁溪，整治措施包括：
一、 設置移動式無線自動監視系統，特別針對南崁溪遭偷倒有害事業廢棄物的地點進行監視查察。
二、成立環保志工隊加強南崁溪查察、檢舉不法：
以鄉鎮為單位，結合相關環保團體或民眾等，成立環保志工隊，加入南崁溪流域污染查察工作。
三、鎖定200家事業，每週由環保機關進行不定期稽查，例假日照常稽查管制。
四、結合大執法專案計畫，拆除南崁溪流域違章電鍍業。
五、進行流域帶狀生態綠美化，創造親水空間。
環保署強調，為整治國內重要河川，提供國人親水、近水的休閒遊憩空間，並提昇國人愛護河川、珍惜環境資源的環境理念，已動員環保署與地方政府，期望早日恢復河川清淨風貌。