南部屏東市地區發現三個登革熱病例，環保署除原已補助屏東縣防治經費500萬元外並緊急派員南下協助屏東縣環保局進行登革熱防治工作。屏東市長安里已於七月十三日完成孳生源清除及緊急噴藥作業，為防範疫情擴大，明天將擴大至週遭詩文、永順、永光、永昌、安鎮、凌雲及鵬程等七個里的防治工作。環保署呼籲民眾，必須每週主動清除居家環境內外積水容器，不要讓病媒蚊孳生，造成登革熱傳播，危害國人健康。
為避免今年九、十月可能發生流行，環保署提醒民眾仍必須每週主動清除居家環境內外積水容器，屋頂陽台、大樓地下室應經常巡視，排除積存的水，住家四周環境的廢棄容器，例如輪胎、鐵鋁罐、帆布、寶特瓶、盆栽墊盤等，也都要加以清理，需用之儲水容器應加蓋，不用時請倒置。
有關七二水災災後環境清理工作，根據環保署統計資料顯示，截至七月十二日為止，各縣市環保單位已清除三萬二千餘公噸垃圾，六萬六千餘公噸污泥，投入清潔人力二萬六千餘人次，消毒面積完成九千六百餘公頃。
另外，為確保飲用水水質安全，環保署已督促地方環保局及自來水事業單位加強飲用水水質抽驗工作，累計至今日飲用水水質計抽驗七百九十二件，檢驗結果計五件不合格，不合格項目為濁度、餘氯、大腸桿菌群密度項目。環保署表示，民眾若自行引用山泉水應確實消毒或煮沸後再飲用。環保署再次呼籲，災區民眾若對飲用水水質有疑慮，可向當地環保局申請代為檢驗，或撥打環保署服務專線─0800231885尋求協助。
又為加速完成七二水災災區之環境清理工作，環保署所設立0800231885(您善意幫幫我)二十四小時服務專線，提供災區民眾有需要環保單位清理災後廢棄物、實施定點消毒及飲用水查驗者等服務之撥打專線，截至十二日為止，計受理五件，包括垃圾清理3件，環境消毒1件，飲用水水質抽驗1件，皆已處理完成。