為積極由源頭改善硫氧化物及其衍生的懸浮微粒污染問題，環保署已於九十一年七月二十六日公告，自九十一年十二月一日起於台南縣、台南市地區的工廠限用含硫量○‧五％的燃料油。環保署說：減少二氧化硫排放的方式有兩種，一為由源頭管制，使用低硫份燃料，另一為污染源管末處理，即於燃燒設備後裝設廢氣脫硫設備，以去除煙氣中的二氧化硫氣體。而加裝脫硫設備的管末處理，工廠必須投資相當高的防制設備成本且持續有效操作，方能有所改善，而由燃料成份予以規範，則是較為徹底有效的方法。
為減少固定污染源排放硫氧化物污染問題，環保署自七十九年起，即依空氣污染防制法開始管制燃料油的含硫量，將含硫量由一‧五％降至八十二年的一‧○％；另針對硫氧化物污染較嚴重的縣市，自八十五年開始，陸續公告限用含硫量○‧五％燃料油的地區，包括：台北市、高雄市、基隆市、台北縣、桃園縣、台中市、台中縣、彰化縣、南投縣、高雄縣及屏東縣等十一個縣市。根據環保署空氣品質監測站資料顯示，空氣中二氧化硫年平均濃度自七十八年的二十八ppb降至九十年的四‧○ppb，降幅達八十五‧七％，顯示由源頭管制燃料油含硫量，確實能有效改善硫氧化物的污染。目前台灣本島尚餘新竹縣、新竹市、苗栗縣、雲林縣、嘉義縣、嘉義市、台南縣、台南市、宜蘭縣、花蓮縣及台東縣等十一個縣市尚未公告限用○‧五％含硫量的燃料油。
鑑於高屏地區空氣污染問題較其他縣市嚴重，除應針對該地區污染源所產生的污染加以控制外，因地形及氣象因素，造成該地區的空氣污染，亦值得注意。為此，環保署邀請經濟部及中國石油股份有限公司、台塑石化股份有限公司等油品公司研商低硫燃料油供應情形，考量油品開放進口後，市場機制及油品供應情形，於九十一年七月二十六日修正公告「含硫量超過一定百分比之燃料油於特定地區使用，為易致空氣污染之物質」，修正公告中，新增台南縣、台南市地區自九十一年十二月一日起限用含硫量○‧五％燃料油，該地區使用含硫量超過○‧五％燃料油之使用者或販賣予該地區使用之販賣者，應先檢具有關資料，向縣市主管機關申請，經審查合格核發許可證後，始得使用或販賣；其販賣或使用情形，應作成紀錄，並依規向主管機關申報。違反前述規定者，依空氣污染防制法第五十八條第一項規定，處新臺幣五千元以上十萬元以下罰鍰；違反者為工商廠場，處新臺幣十萬元以上一百萬元以下罰鍰，環保署也籲請業者及早因應。
據環保署預估實施後，一年最多可減少硫氧化物排量八、○七五公噸，對改善高屏地空氣品質有實際的幫助；倘實施後評估油品供應不成問題，則將持續推動下階段針對雲林縣、嘉義縣及嘉義市公告使用，再公告新竹縣、新竹市及苗栗縣，希能早日達到台灣西半部地區全面限用含硫量○‧五％燃料油的目標。