日月潭是台灣國家級風景特定區，為免水質遭受破壞，環保署強調，針對區內飯店的污水排放處理，向來皆列為當地稽查重點，強力查察。對涵碧樓大飯店過去三年內，分別於95年及96年間，以暗管偷排廢水及未經申請許可排放冷卻水等違法情事，環保署及地方環保單位亦先後開單處分，以維護日月潭水質。
環保單位依水污染防治法規定，依法管制日月潭區內餐飲業、觀光飯店，計有涵碧樓大飯店股份有限公司、日月潭教師會館、天廬育樂事業股份有限公司、日月潭青年活動中心、水沙蓮觀光飯店股份有限公司、中美企業股份有限公司-中信酒店等6家。不定期派員稽查其廢污水處理、排放情形，自93年迄今，共稽查131次，違反水污染防治法者，均依法處分。
環保署指出，透過不定期稽查，日月潭水質相當良好，根據環保署94年至96年水質監測結果，卡爾森優氧指標（CTSI）大皆屬貧養，符合一級公共用水、游泳、乙類、丙類、丁類及戊類標準，民眾可以放心。
環保署也定期統計所有事業各項稽查、處分情形，予以公開，民眾可至環保署網站查詢，並依據業者違規情節嚴重性，及對社會大眾生命財產安全影響的必要性，加重處罰，適時公告，以督促業者做好污染防治工作。