近來傳出有斃死豬流入市面案件發生，環保署為嚴格規範清理流向，將針對1000頭以上畜牧養豬業者優先進行稽查，期能減低民眾疑慮，並遏止養豬業者豬糞尿及污泥等事業廢棄物未經處理流入河川情形發生。此外，環保署並公告修正「應以網路傳輸方式申報廢棄物之產出、貯存、清除、處理、再利用、輸出及輸入情形之事業」，其中養豬業者網路申報門檻下修，規範飼養3000頭以上豬隻之業者，於今年（94年）7月1日起，即應上網申報廢棄物清理流向。
相關研究資料指出，每頭成豬每天約產生30公斤糞尿，其中固形物佔2-3%，經固液分離後約為0.6至0.9kg/day，其他液體部分經廢水處理後約產生0.1至0.15 kg/day污泥，總計每頭豬約產生1公斤污泥/天(含固態豬糞)，依此推估飼養1000頭以上豬隻畜牧業，每天約產生1噸污泥（含固態豬糞），目前依本署列管飼養豬隻統計飼養1000頭以上者共計有1718家，為有效遏阻污泥隨意棄置之情事，將針對事業廢棄物產生量較大的養豬業者進行現場稽查，該些廢棄物及斃死禽畜之流向，都是環保署關切的重點。另同時針對6家收受斃死禽畜及屠宰豬隻下腳料之化製場，也將一併查核其現場運作情形。
環保署表示，針對畜牧養豬業，除加強查核其事業廢棄物清理流向，遏阻污染行為外，另已規劃未來下修網路申報之門檻，並將斃死畜禽清運車輛納入廢棄物清理法加裝GPS的對象，未來將可掌握絕大部分畜牧養豬業者事業廢棄物流向，減少民眾的疑慮。