由於水情吃緊，部分地區已開始實施限水，環保署請民眾特別注意飲用水安全，不要飲用來源不明的水、購買包（盛）裝飲用水應注意衛生標示、儲水應加蓋、飲用水應煮沸後再飲用，此外，停水期間應關閉抽水馬達電源，以免管線負壓狀態等，以確保飲用水的安全。
為維護乾旱期間之飲用水安全，環保機關已加強缺水地區的公共飲用水水質抽驗，104年1月到3月15日環保單位抽驗限水縣市1,110件自來水水質，結果顯示均無異常，相關資訊已公布於該署網站之抗旱資訊專區（http://www.epa.gov.tw/mp.asp?mp=dt），後續將持續公布自來水抽驗結果。
除由環保機關加強飲用水水質抽驗，以保障飲用水安全，環保署再次提醒，在缺水時期民眾飲用水應注意下列各點以確保安全：
一、不要飲用來源不明的水。
二、民眾如須購買包盛裝飲用水，請留意其食品衛生標示。
三、在儲水時應加蓋，避免二次污染，並不要貯存過久。
四、飲用水應煮沸後再飲用，並建議至少3分鐘，以確保飲用水的安全。
五、請檢查家中用水設備，不要私自變更水池、水塔構造，以免發生飲用水污染情事。
環保署並提醒民眾，缺水時期如非緊急暫不要清洗水塔，如要清洗水池、水塔，為珍惜寶貴的水資源，水塔清洗用水請再加以利用。另外，自來水建議不必再接用淨水器，如自來水接用逆滲透淨水器，由於逆滲透淨水器的出水量遠較進水量低，請將過濾餘水收集後再利用。
另針對停限水地區，環保署請民眾注意台灣自來水公司透過廣播、網路、張貼公告等方式所提供之水質資訊及因應措施，如減量及定點供水方式、水質是否適合飲用或作為洗滌等生活用水等，或撥打自來水公司客服專線1910洽詢。環保署網站抗旱資訊專區(http://www.epa.gov.tw/lp.asp?ctNode=34473&CtUnit=2466&BaseDSD=7&mp=dt)已連結相關單位的抗旱資訊供參。
此外，環保單位並針對限水區域加強稽查取締供水水庫集水區及淨水廠取水口上游污染源。民眾如發現水源區有異常污染，請撥打0800-066-666專線通報，俾利環保單位追查污染源，共同維護水源水質安全。