環保署為防止因蓄水池水塔清潔維護或設置不當引起之水質污染，訂定「自來水用戶蓄水池、水塔清潔維護計畫 」，自今（九十三）年起分階段宣導。今年度預定執行對象為中小學校及區域醫院。
環保署表示，台灣地區自來水普及率已達九十.八八 ﹪（其中台北市九十九.四九 ﹪，台灣省八十九.○九﹪），自來水直接供水點（經水池、水塔之前）水質合格率已達九十九﹪以上。
根據環保署民國九十年委託調查台北市、台中市、高雄市三大都會區經過蓄水池及水塔後的自來水，水質不合格率為三十五﹪，其中有九﹪測出含有大腸桿菌群密度，顯示極需加強蓄水池及水塔清潔維護，以確保飲用水安全。
環保署說，該計畫的具體執行，將請各縣市環保局將水質餘氯簡易測試藥劑分送到學校及醫院，並會同各地自來水事業單位召開蓄水池、水塔檢查及水質餘氯自行檢驗說明會，學校及醫院自行檢查蓄水池、水塔設備、自行檢驗水質及自行維護改善，並將檢查及檢驗結果登錄於環保機關網站，由環保機關及自來水事業單位追蹤其成效，必要時派員協助檢查。
目前自來水用戶蓄水池、水塔常見的污染原因包括：
（一） 蓄水池設於建築物地面或地板下面，因為外壁緊接地下土壤，污水易從池壁裂縫滲入。
（二） 蓄水池人孔比四周低，且孔緣未提高，使雨水、污水或油漬流入。
（三） 人孔蓋破損或遺失，使雨水、塵埃、鳥糞、小動物、昆蟲及雜物侵入。
（四） 溢水管、排水管及通氣管未裝防蟲網，使老鼠及蟑螂等害蟲侵入。
（五） 蓄水池、水塔容量過大，而用水量少，使自來水中具自我消毒能力的餘氯揮發殆盡。
（六） 長期未清洗，淤積污垢，甚至產生綠藻發生臭味。
（七） 飲用水池與消防水池併用，因逆止閥故障使消防水進入水池造成水池污染。
（八） 馬達直接由配水管網抽水污染。
以上各種常見污染原因，除了蓄水池設於地板下及馬達直接由配水管網抽水兩項的改善需要另外找地方重新設置蓄水池較麻煩外，其它缺點都可以透過簡易的配備更換調整或改善；另台灣省自來公司及台北自來水事業處已有輔導優良清洗水池、水塔業者供用戶選擇，民眾可直接在該兩單位網站查詢，網址為http://www.water.gov.tw/sample1/know/use/use.htm（台灣台灣省自來公司）
http://www.epa.gov.tw/j/drinkwater/index1.html（台北自來水事業處）
環保署強調，希望透過該計畫的執行，能讓各中小學校及醫院找出蓄水池、水塔的缺失並加以清潔維護及改善，使中小學及醫院人員都能更安心的使用乾淨的自來水。