環保署為持續鼓勵民眾儘速淘汰二行程機車及新購電動二輪車，特別針對執行期間各界反映之問題，適度修正相關補助規定，於107年4月17日修正發布「淘汰二行程機車及新購電動二輪車補助辦法」。
環保署表示，由於二行程機車因引擎設計，進排氣同時機油混合進入汽缸中燃燒，容易因燃燒不完全而產生青白煙，造成空氣污染，與四行程引擎比較，在碳氫化合物（HC）方面，二行程機車污染度為四行程機車之17至18倍，一氧化碳（CO）約為2倍。因此該署於93年起加嚴新車排放標準，促使車廠不再生產二行程機車；對於已售出使用之二行程機車，則自97年起提供汰舊補助，以鼓勵民眾加速汰除老舊二行程機車，惟經統計截至3月底，二行程機車仍有約103萬輛，對空氣污染的防制影響仍相當大，有必要再加速淘汰。
環保署指出，執行補助汰換過程中，發現民眾多集中於年底辦理報廢與回收二行程機車，造成回收商調度困難而未能及於同年底完成車體回收，經檢討修正為申請淘汰二行程機車補助者，以完成報廢日期為準，作為判定補助之年度。另為避免老舊二行程機車因缺乏定檢紀錄，無法獲得補助而影響汰換意願，也刪除須有檢驗紀錄始能申請汰除二行程機車補助之規定。
對於淘汰二行程機車及新購電動二輪車補助，環保署表示，本項補助金額採逐年遞減，今年淘汰二行程機車補助金額有1,000元，淘汰二行程機車並新購電動二輪車視車種有4,000至6,000元不等之補助，新購電動二輪車視車種1,500元至3,500元不等補助，地方政府亦提供加碼補助，詳細資訊可上該署移動污染源管制網（https://mobile.epa.gov.tw/TopNews/OldMotorbike.aspx）查詢，但109年即不再補助。
環保署強調，空氣污染防制法修正草案已於立法院審議中，未來將加嚴10年以上交通工具原適用之排放標準，以及授權各級環保機關依轄內狀況劃設空氣品質維護區，例如學校、市場周邊或特定區域，限制或禁止特定車輛（如老舊二行程機車、一二期柴油車等）駛入；未來地方環保機關亦將加強車輛攔查攔檢，違反者，可予以裁罰，以維護環境空氣品質。因此，未來二行程機車上路行駛將更具不便性，呼籲二行程機車車主把握機會儘早將二行程機車汰除，改用大眾運輸或是電動二輪車代步，共同為維護空氣品質盡份心力。