為了在下水道建設普及之前能有效處理生活污水，改善河川水質，環保署推動各項水質淨化設施，補助地方政府設置礫間接觸氧化、污水截流、人工濕地及漫地流，減少當地污染並改善水質，維護河川原本生態及周邊地景環境，與地方政府共同推動計畫包含桃園市四方林排水水質淨化、臺中市黎明溝水環境改善工程、臺南市月津港水質改善及污水截流等共75案，每日處理水量44.4萬公噸，營造出約64.9公頃的親水空間。
為達「水與環境」之「與水共生、共存、共榮」願景及營造「魅力水岸」之目標，行政院環境保護署致力於推動治水、淨水、親水一體，結合生態保育、水質改善及周邊地景之水環境改善，加速改善全國水環境，期能恢復河川生命力及親水永續水環境。
以桃園市「四方林排水水質淨化工程」為例，該工程是利用礫間接觸曝氣氧化工法淨化水質，希望藉由大自然河川自淨作用恢復河川生命力，不需添加藥劑，每日可處理生活污水約2,500公噸，污染去除率可達70%以上。該工程改善下游老街溪美都麗橋測站水質污染程度，由中度污染等級降至輕度污染等級。礫間設施完工後，上部亦復原為公園草坪及槌球場，給附近居民更好的生活環境空間，兼顧淨水與民共存的整治目標。
「黎明溝水環境改善工程」由環保署與臺中市政府攜手努力，辦理黎明溝水環境改善計畫，包含有設置水質監控設備及自動控制閘門，掌握上游水質變化、並即時阻斷污水流入黎明溝水域，設置環境教育解說平台並營造多樣化生物棲地，讓在地居民得以更加親近河川水域。
環保署致力水環境改善，秉持著「唯有淨水，才能親水」的精神，以改善河川水質為首要目標，從上至下游逐步改善河川水質，活化河川內之物種豐富性與多樣性，並配合周遭環境景觀營造，增進民眾親水的意願，創造出居民、河川與生態的三者共融環境。