環保署13日表示，蘭嶼海域油污染清除作業截至13日止，嚴重污染面積清除已達90﹪。台東縣環保局並再次委請國立成功大學水工試驗所，針對本次油污染沿岸附近海域3個地點，進行水質採樣檢測，共採9個水樣送驗，預計最快7月18日提出檢驗報告。
環保署指出，清出的廢油將於14日運往台東縣富岡港，並轉送高雄中油公司處理。
13日清除作業清出0.4噸的油污與0.8噸的垃圾，整個清理工作截至7月13日共已清出約9.7噸的油污及12.8噸的垃圾。有關所動員的人力機具部分，13日共動員72人次(包括：蘭嶼鄉公所1人、台東縣環保局2人、環保署契約商及雇工67人、環保署2人)、汲油器與吸油棉等人力機具。