環保署為解決養豬廢水長期污染南部地區飲用水水源問題，自八十九年底執行高屏溪等養豬戶拆除補償計畫以來，迄今將屆四年，檢視改善成效以高屏溪大樹攔河堰測站水質氨氮項目來看，已由八十九年的0.6毫克/公升降至今（九十三）年的0.2毫克/公升左右並穩定維持，符合飲用水水源水質標準。
環保署執行高屏溪等養豬戶拆除補償計畫，除有效解決養豬廢水污染水源困擾，更因清澈水質吸引民眾願意親近河川，四年來環保單位持續不斷執行稽查結果，使四千多家拆遷戶均無原地重建復養情形發生，為大高雄地區民眾飲用水品質做好第一線把關。
環保署表示，為改善飲用水水源水質，擇定高屏溪大樹攔河堰以上地區之養豬戶為拆除補償對象，主要養豬戶集中高雄縣美濃鎮及屏東縣高樹鄉，高屏兩縣合計拆除補償四千多戶，約46.6萬頭豬隻，環保署為防範養豬戶受理補償後可能重新畜養或原地重建復養情形，經四年來持續明查暗訪，並無發現復養情形。
環保署強調，養豬戶拆除補償範圍係屬高屏溪中、上游地區，在豬隻遷離後，河流水質較以往清澈許多，且河面漂浮豬糞情形已不復見，每逢假日到溪邊遊憩的民眾也增多了。
環保署呼籲，高屏溪大樹攔河堰以上地區將持續列為稽查重點，已拆遷養豬戶如有重新畜養等不法行為，一經查獲將嚴格處分，以維護水源水質之潔淨。