對於媒體報導感染性事業廢棄物清理流向控管不佳，要求政府提出對策乙事，環保署廢管處今天上午表示，對國內感染性醫療廢棄物管理，從產出清除處理到流向申報，均已建立完整管理體系，對感染性事業廢棄物稽查也一向列為各級環保單位工作重點，對於可能非法亂倒案件，呼籲民眾及醫療院所人員踴躍提出檢舉。
環保署表示，目前全國醫療院所約一萬八千家，依照目前規定，凡許可病床五十床以上的醫院，都必須依規定以網路方式申報感染性廢棄物產出及清理流向，五十床以下的其他小型醫院及診所，產出的感染性廢棄物也必須填送六聯單，供環保單位追蹤管理。以目前上網申報量及六聯單申報量合計，約每年一萬三千公噸。而目前合法感染性事業廢棄物清除機構達家一百多家，合法處理機構也達二十六家，總處理量達每日一百八十公噸，遠超過目前每日產出量平均四十公噸。
至於衛生署所作的調查統計數字，經環保署廢管處再次向衛生署醫政處查證後瞭解，衛生署係以民國八十九年及九十年委託工研院所作調查，據以推估得平均每一病床產出廢棄物量，再以推估佔床數計算所得，故原則上屬於推估值，而環保署則是醫療院所每日實際產出的申報值，由於推估病床數與實際佔床數仍有不同，因此兩者結果必然有所差異。
另環保署廢管處表示，統計九十年四月起到目前，約兩年期間，各級環保單位稽查醫療廢棄物相關案件次數，達九千五百次，即平均每兩家醫療院所就稽查一次，因此各級環保單位對醫療廢棄物之稽查管理，絕對是擺在第一優先順位，但環保署不排除仍有不法業者未依規定妥善清理的情形，因此環保署除將邀集相關單位研商強化相關稽查管理機制外，也同時呼籲所有民眾及醫療院所人員，能踴躍提出檢舉。報案電話：０８００︱０６６６６６，以完全杜絕非法清理行為。