有關媒體報導「剩藥無處去 60%亂丟污染環境」、「過期藥丟馬桶 污染環境」等訊息，環保署特予說明。民眾家中存放的過期廢藥品，屬於一般廢棄物，係由執行機關（環保局、公所清潔隊）負責清除，並作適當之處理。因執行機關所清理的一般廢棄物中，藥品所佔比例極少，與其他家戶垃圾合併焚化，除能符合聯合國的技術準則，執行機關垃圾焚化廠亦有足夠污染防治設備確保妥善處理，不會造成環境污染；另環保署呼籲民眾切勿把家中廢棄藥品沖入馬桶，並將配合衛生單位加強宣導。至於醫療機構、藥廠產出之廢棄過期藥品，屬事業廢棄物，大多透過委託清除處理或共同清除處理方式，由合法專門之處理廠商以熱處理法（含焚化）處理。
環保署呼籲，民眾家中如有廢棄過期藥品時，可交由執行機關（環保局、公所清潔隊）清除處理，或交回原藥局、診所、醫院回收，切勿沖入馬桶，以免造成河川污染。