環保署表示，廢棄物清理法自90年10月修正公布後，已於廢棄物清法第24條授權訂定「一般廢棄物清除處理費徵收辦法」，依該法第3條規定，一般廢棄物清除處理費之徵收，應按用水量計算徵收、或按戶定額計算徵收、或按垃圾量計算徵收（隨袋徵收）。惟地方政府得衡酌實際作業需要，訂定其他費用徵收方式。
由於垃圾費隨自來水用水量附徵方式，具較低徵收成本及業務執行便利性，雖沒能似隨量(袋)徵收完全符合使用者付費、污染者付費原則，但大多縣市仍採該方式進行一般廢棄物清除處理費之徵收。環保署亦表示，若推動「垃圾費隨袋徵收」，尚須各縣市條件，包括：首長之執行意願、財政是否充足、垃圾清理特性、環保人力機具資源是否足夠，以及民眾是否支持等主、客觀因素，才可實施及推動成功。因此，目前國內實施垃圾費隨袋徵收之縣市，僅有臺北市、臺中縣石岡、臺北縣(深坑、八里、石碇、鶯歌、永和、土城)。
此外，臺北市自89年實施垃圾費隨袋徵收制度，造成徵收之垃圾清除處理費逐年下降，自90年之8.16億元（清理成本27.25億元），逐年下降至96年之4.63億元(清理成本31.70億元)，另96年行政費用支出（包含專用垃圾袋製作、行銷、防偽封標籤製作等）為1.1億元，惟臺北市因財政較充裕，減少之垃圾清除處理費尚可以編列公務預算協助支應，其他縣市在沒有相同財政條件，較難選擇隨袋徵收。
環保署最後強調，目前各縣市政府採用隨用水量徵收一般廢棄物清除處理費，係各地方政府考量自己轄內垃圾清理所為之行政行為，亦為符合廢棄物清理法規定之方式。但由於地方政府條件不同，環保署將持續瞭解地方推動隨袋徵收相關條件，並將因地制宜處理，協助符合條件之地方政府推動實施垃圾費隨袋徵收。