有關「宣導衛生紙丟馬桶」媒體報導，環保署鄭重回應表示，經綜合考量管線阻塞、河川污染、節能減碳及衛生紙材質分辨等4個因素，顯示衛生紙丟馬桶之宣導仍不適宜鼓勵。
首先，衛生紙使用後沖入馬桶，雖然方便解決廢棄物問題，但目前國內市售一般盒裝及隨身面紙，質地屬"長纖"纖維，遇水不易碎爛，民眾不易辨識，常誤以為廁所衛生紙，如丟入馬桶內容易發生阻塞排水管線問題。
其次，我國目前公共污水下水道普及率約18％，污水下水道並不普及，如將使用後衛生紙投入馬桶，容易在未妥善處理情況下，排入河川水體，增加河川中污染物質濃度。
再者，以節能減碳觀點而言，衛生紙使用後投入馬桶，在管路輸送過程中，仍需以馬達加壓輸送，亦增加能量消耗，到污水處理廠處理亦要耗費能源，另衛生紙屬高熱質廢棄物，如採焚化處理，可增加發電量。
另民眾使用習慣亦是要考量的因素之一，以國人使用習慣而言，廁所設置垃圾桶，其目的為丟棄衛生紙、生理用品、盥洗清潔用品等，民眾已習慣在如廁後將相關廢棄物扔入馬桶旁垃圾筒中，如不設置垃圾筒，民眾恐將不適合投入馬桶中之垃圾，一併扔入馬桶中，而造成馬桶阻塞。
因此，考量我國下水道建設情形及國人使用習慣，現階段環保署並不鼓勵將使用後之衛生紙投入馬桶。