環保署委託檢驗測定機構檢測於97年1至12月抽驗164處自來水供水系統及36處簡易自來水供水系統，共計採取360個水樣，包含重金屬(砷、鉛、硒、鉻、鎘、鋇、銻、鎳、汞、銀)、農藥(安殺番、靈丹、丁基拉草、2,4-地、巴拉刈、納乃得、加保扶、滅必蝨、達馬松、大利松、巴拉松、一品松、亞素靈)、揮發性有機物(三氯乙烯、四氯化碳、1,1,1-三氯乙烷、1,2-二氯乙烷、氯乙烯、苯、對-二氯苯、1,1-二氯乙烯)、氟鹽及消毒副產物總三鹵甲烷等33個水質項目，經檢測後均符合飲用水水質標準(管制標準如附表)。
97年度飲用水水質監測結果發現，各抽驗點分析項目之檢測點合格率為百分之百，其中僅雲林縣麥寮淨水場之砷(檢測值為0.00733 mg/L)及澎湖縣七美淨水場之總三鹵甲烷(檢測值為0.0702 mg/L)等測項測值接近飲用水水質管制標準〔砷：0.01 mg/L、總三鹵甲烷：0.08 mg/L〕，環保署表示，砷主要是地質因素影響，總三鹵甲烷則是水源中的有機物質與消毒劑氯氣的反應副產物，雖然仍在標準範圍內，環保署已督請雲林縣及澎湖縣環保局於98年度持續追蹤，並將相關檢驗成果報告函送各自來水事業單位參考。
環保署強調，飲用水品質是民眾日常生活關切事項，也是政府施政的重點。依本次抽驗全國飲用水中重金屬、揮發性有機物及總三鹵甲烷等有害健康項目的結果得知，公共飲用水水質中影響健康項目的化學物質均符合標準，顯示公共供水品質已具有相當程度之安全性與穩定性，環保單位將持續進行飲用水水質的監測，並函請自來水事業強化淨水場水質處理流程、操作方式及加強水質的監控，督促自來水事業單位及簡易自來水管理單位提升淨水處理技術。