環保署有鑑於近年來發生斃死豬隻或於屠宰過程中淘汰之下腳料，因流向不明，甚至非法流入市面供於食用，造成消費者恐慌，為保障消費者權益，及考量社會輿論，該署將擴大要求2,000頭以上之豬隻畜牧場應檢具事業廢棄物清理計畫書送審，並上網申報廢棄物清理流向，本次下修豬隻畜牧場列管門檻以一次公告分二階段實施方式辦理，預計新增列管共約307家事業，第一階段為2,500頭以上豬隻畜牧場自99年7月1日起實施，第二階段2,000頭以上豬隻畜牧場自100年7月1日起實施，並配合現行載運斃死畜禽或畜禽屠宰下腳料之車輛應裝置即時追蹤系統（GPS），預估每年約可再精確掌握約7,000公噸之斃死豬及畜禽屠宰下腳料清理流向，可防範斃死豬非法流供食用。
環保署表示，為使事業產出之事業廢棄物能妥善處理及回收再利用，自87年起即陸續將容易產出量大及有害事業廢棄物之廢棄物產源，逐批公告為應上網申報廢棄物清理及再利用情形，且於89年10月成立「事業廢棄物管制中心」執行事業廢棄物管制工作，並逐年擴大列管事業應檢具事業廢棄物清理計畫書及上網申報廢棄物清理流向之事業，目前已公告列管3,000千頭以上之豬隻畜牧場為應上網申報事業廢棄物清理流向之事業，每年約能掌握2萬公噸之斃死豬及畜禽屠宰下腳料之清理流向。
環保署進一步表示，為讓新納入列管之事業能順利檢具事業廢棄物清理計畫書送審及上網申報廢棄物清理流向，於實施前將辦理宣導說明會，並製作教學光碟、說明會講義及相關資訊彙編，提供事業參考使用，另設置0800-059-777免付費客服專線，提供事業詢問相關申報問題及同步連線輔導事業上網申報。該署同時籲請新納入列管事業，屆時應配合檢具事業廢棄物清理計畫書送審及上網申報廢棄物流向，為環境保護盡一分心力。