行政院環保署為提供清除、處理機構專屬之服務網站，並提升使用者更優質便利之查詢服務，及促使環保機關更有效管理轄內的清除、處理機構，自101年起著手規劃建置「清除處理機構服務管理資訊系統」(網址: http://wcds.epa.gov.tw/)，目前已完成系統功能建置，訂於103年5月1日正式啟用。並已要求各地方環保局輔導轄內清除機構及處理機構上網登錄，並落實管理。
本系統功能共分為「公開資訊」、「許可申請」、「許可審查」、「申報作業」、「稽查查核」、「資訊查詢」、「統計分析」、「資料維護」等八大功能，系統正式上線後之預期成效說明如下：
1.資訊分享，便捷服務與管理
產源事業及一般民眾，可透過本系統查詢全國合格清除、處理機構名單及最新法規修正情形；清除、處理機構，可於系統掌握各項管理新知，及會議訊息，並可橫向連結至相關系統進行廢棄物流向申報；環保機關可依權責分工，進行相關稽查管制工作。
2.經驗交流，互動溝通
本系統提供環保機關針對轄內績優事業進行表揚，使產源事業及民眾可於線上查詢清除處理機構之優良事蹟，並提供清除處理機構透過系統功能，與環保機關人員進行問題反應與意見回覆，有利雙方的橫向聯繫。
3.線上申請，全面e化
清除、處理機構可藉由本系統執行清除、處理許可證之申請、變更、展延等作業，環保機關於收到申請案後，亦可藉由本系統進行後續許可審查及證書核發作業，達到全面e化管理之目標（本功能預計於103年9月啟用）。
此外，環保署表示，目前全國清除機構3,602家，處理機構168家，未來可結合本系統功能之進一步強化，建立處理機構即時監督機制，遏止非法棄置之發生。