在環保署、地方政府以及民間團體的努力下，二仁溪的嚴重污染長度比率已自92年的100%，降到104年(1-10月)的14.2%。環保署今（23）日假台南長榮大學舉辦「二仁溪風華再現」記者會，向國人宣布二仁溪整治初步成效，以及沿岸活化新風貌。環保署長魏國彥宣誓，數年內一定要將二仁溪污染降到0%，尋回二仁溪的昔日風華。
多年來環保署與地方政府齊心整治二仁溪，而二仁溪河川巡守隊亦積極投入河川整治工作，目前有22隊471人堅守復育的崗位，經營不懈。長榮大學協助整合南部縣市民間巡守，推動河川保育及環境教育；臺南市社區大學積極投入環境保護及通報；臺南市二行里及大潭社區等河川巡守隊發揮在地力量；高雄市茄萣區舢筏協會巡守污染嚴重的二仁溪下游，成為全國以船隻巡守河川的守護先趨，皆為國內河川巡守隊優良義工的典範。而二仁溪河川巡守志工成功經驗，也讓環保署思索將此經驗擴展到空污防制。環保署長魏國彥表示，下個月起將推動「公民科學，社區參與」，利用行動裝置的便利性，擴大社區參與意識，讓全民加入空污監測的行列。
台南市長賴清德對於環保署的全力支持表達感謝。賴清德表示，環保署對於二仁溪整治不遺餘力，近期內投入3億6,000萬興建污水處理廠，8億2,000千萬建設廢棄物清理廠，前後十餘億元經費，對於二仁溪整治有莫大的助益。環保署長魏國彥則表示，二仁溪整治非一朝一夕，而是十多年來不間斷的努力。
二仁溪的污染及整治，呈現出資源再利用的省思。地球礦藏逐漸耗竭，早1年廢金屬工業的興起，正因為對於資源的需求。在技術已大幅提升的今天，如何讓人們口中的垃圾獲得更無污染、更有效的利用，是刻不容緩的議題。環保署計畫，未來結合政府各部門訂定「永續物料管理推動計畫」，並成立跨部會平台，共同從整體資源調配的上位角度管理，以循環再利用為缺乏天然資源的台灣，找尋一條永續的道路。