媒體報導擱淺之紐埃籍耘海（YUN HAI）輪於105年3月7日被發現船舶漏油污染海面，環保署於接獲通報後，即督導澎湖縣政府環境保護局洽澎湖縣海巡隊前往巡查，當日下午3時12分及4時24分回報結果表示現場未發現明顯海面油污狀況，經澎湖縣環保局研判海面零星油污，可能來自於船體表面殘油，而非漏油。環保署已督導澎湖縣環保局即以吸油棉吸取零星油污，並協調澎湖縣海巡隊持續監控，確保當地海域環境品質。
環保署表示，紐埃籍耘海（YUN HAI）輪（載有145公噸柴油）於2月25日凌晨擱淺於澎湖縣小白沙嶼岸際，該署當日即啟動重大海洋油污染緊急應變機制及於澎湖縣召開跨部會油污染緊急應變會議，協調督導相關單位依權責預為因應，尤其是船上油品的移除與後續船體拖救事宜；連日來持續掌握相關單位備變岸際與海上緊急應變資材狀況，並使用油污染擴散模擬系統掌握油污洩漏後24小時內可能影響範圍，及運用衛星監控現場海域油污染狀況，提供現場應變參考。
環保署表示，船東委託之朝國海事工程公司已於3月4日完成第一道攔油索布設工作，避免油污外洩。交通部航港局今（8）日則於澎湖縣召開「耘海（YUN HAI）輪擱淺緊急應變第3次會議」，依會議結論，已要求朝國海事工程公司於天候狀況允許前提下，原則應於3月10日前於赤崁村整備完成所需抽油設備，3月11日布設抽油管線設備及開始執行抽油作業，及於3月15日前完成船上殘油抽除工作，避免油污外洩之虞。
環保署將督導澎湖縣環保局掌握船體殘油抽除進度，在未完成抽油作業前，持續與相關單位共同合作，完備相關應變資材備變工作及海面油污監控作業等，避免耘海輪油污外洩造成當地海域水質及生態環境受到影響。