有關自由時報於99年8月2日報載環境律師說：「環署可依法 要求六輕全面停工」一文，其中詹順貴律師表示「應該從更高位的『環境影響評估法』，重新檢視六輕在空氣、土壤、廢棄物及水資源方面，一旦確認有違反事證，環保署就可以『違反當年六輕環評結論』為由，要求六輕全面停工。」因所述意見與現行環境影響評估法規定不符，為免民眾誤解，特提出澄清說明。
環保署表示，開發單位如有違反環評審查結論，應依照環評法第23條第1項規定先處以30萬至150萬元罰鍰並限期改善；屆期仍未改善者，按日連續處罰，其違反情節重大者才處以停工。依照台塑99年7月25日發生之火災，屬工安事件，並無違反環評審查結論情事，欲要求因此而命其停工，依法不符。該署同時說明，六輕計畫由13家公司共同提出開發，台塑石化麥寮一廠煉油二廠工安事件，業經依空氣污染防制法勒令停工，惟其他12家共同開發單位並無違反相關法令，不適用空氣污染防制法或環境影響評估法規定，須命六輕計畫全面停工。
環保署強調，為加強六輕相關計畫之環評監督，該署自民國83年即成立「六輕相關計畫環境影響評估相關計畫審查結論執行監督委員會」辦理專案監督，該署並多次依環境影響評估法規定對開發單位處以罰鍰，並命其提出環境影響調查報告。該署重申，未來仍將以依法行政之立場，辦理六輕計畫相關監督工作，以預防及減輕開發行為對環境造成不良影響。